เรื่องราวของ โคบาโตะคุง เด็กหนุ่มผู้ที่อยากใช้ชีวิตอย่างเงียบสงบและเป็นคนธรรมดา หลังจากได้พบกับประสบการณ์อันแสนเจ็บปวด เช่นเดียวกันกับเพื่อนร่วมห้องของเขาอย่าง โอซาไนซัง ที่ต้องการความเป็นคนธรรมดาเหมือนเขา ถึงแม้ว่าทั้งคู่ต้องการใช้ชีวิตอย่างสงบสุข แต่กลายเป็นว่าพวกเขาต้องเข้าไปพัวพันกับเรื่องราวปริศนาที่เกิดขึ้นอย่างต่อเนื่อง จนทำลายชีวิตที่แสนจะธรรมดาของพวกเขา